Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPPED1Q9BRF8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPPED1Q9BRF8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms