Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc24a3Q99PD7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc24a3Q99PD7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms