Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vgll1Q99NC0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll1Q99NC0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms