Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Pcgf6Q99NA9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Pcgf6Q99NA9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Pcgf6Q99NA9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Pcgf6Q99NA9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms