Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4dQ99N05 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4dQ99N05 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4dQ99N05 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4dQ99N05 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4dQ99N05 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4dQ99N05 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4dQ99N05 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4dQ99N05 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4dQ99N05 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4dQ99N05 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4dQ99N05 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ms4a4dQ99N05 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ms4a4dQ99N05 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ms4a4dQ99N05 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Ms4a4dQ99N05 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a4dQ99N05 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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Ms4a4dQ99N05 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Ms4a4dQ99N05 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a4dQ99N05 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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