Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpgs1Q99MS8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpgs1Q99MS8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms