Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SrrtQ99MR6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms