Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BrapQ99MP8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BrapQ99MP8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BrapQ99MP8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.3 ms