Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clp1Q99LI9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clp1Q99LI9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms