Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sh3bp5lQ99LH9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bp5lQ99LH9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sh3bp5lQ99LH9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms