Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RtcbQ99LF4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RtcbQ99LF4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RtcbQ99LF4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms