Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lysmd3Q99LE3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lysmd3Q99LE3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lysmd3Q99LE3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms