Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SardhQ99LB7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SardhQ99LB7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SardhQ99LB7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SardhQ99LB7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SardhQ99LB7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SardhQ99LB7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms