Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lactb2Q99KR3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lactb2Q99KR3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms