Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sdcbp2Q99JZ0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdcbp2Q99JZ0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdcbp2Q99JZ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms