Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd1bQ99JY6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1bQ99JY6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms