Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3CQ99985 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3CQ99985 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms