Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMOQ99835 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMOQ99835 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMOQ99835 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMOQ99835 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMOQ99835 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMOQ99835 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMOQ99835 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMOQ99835 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMOQ99835 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMOQ99835 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMOQ99835 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMOQ99835 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMOQ99835 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMOQ99835 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMOQ99835 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMOQ99835 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMOQ99835 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMOQ99835 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMOQ99835 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMOQ99835 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMOQ99835 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMOQ99835 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMOQ99835 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMOQ99835 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMOQ99835 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMOQ99835 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMOQ99835 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMOQ99835 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMOQ99835 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMOQ99835 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMOQ99835 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMOQ99835 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMOQ99835 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMOQ99835 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMOQ99835 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMOQ99835 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMOQ99835 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMOQ99835 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMOQ99835 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMOQ99835 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMOQ99835 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMOQ99835 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMOQ99835 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMOQ99835 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMOQ99835 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMOQ99835 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMOQ99835 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMOQ99835 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMOQ99835 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMOQ99835 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMOQ99835 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMOQ99835 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMOQ99835 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMOQ99835 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMOQ99835 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMOQ99835 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMOQ99835 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMOQ99835 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMOQ99835 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMOQ99835 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMOQ99835 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMOQ99835 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMOQ99835 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMOQ99835 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMOQ99835 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMOQ99835 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMOQ99835 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMOQ99835 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMOQ99835 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMOQ99835 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOQ99835 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOQ99835 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOQ99835 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOQ99835 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOQ99835 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOQ99835 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOQ99835 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOQ99835 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOQ99835 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOQ99835 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMOQ99835 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMOQ99835 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMOQ99835 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMOQ99835 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMOQ99835 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMOQ99835 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMOQ99835 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMOQ99835 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMOQ99835 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMOQ99835 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMOQ99835 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMOQ99835 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMOQ99835 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMOQ99835 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMOQ99835 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMOQ99835 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMOQ99835 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMOQ99835 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMOQ99835 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms