Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX18Q96RF0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX18Q96RF0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms