Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCLT1Q96NL6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SCLT1Q96NL6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms