Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF560Q96MR9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF560Q96MR9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF560Q96MR9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF560Q96MR9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms