Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNBD2Q96M20 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNBD2Q96M20 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms