Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHAMP1Q96JM3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms