Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SUCLG2Q96I99 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SUCLG2Q96I99 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SUCLG2Q96I99 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SUCLG2Q96I99 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SUCLG2Q96I99 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SUCLG2Q96I99 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SUCLG2Q96I99 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SUCLG2Q96I99 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SUCLG2Q96I99 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SUCLG2Q96I99 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SUCLG2Q96I99 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SUCLG2Q96I99 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SUCLG2Q96I99 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SUCLG2Q96I99 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SUCLG2Q96I99 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 300.4 ms