Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCMH1Q96GD3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms