Protein–RNA interactions for Protein: Q96G23

CERS2, Ceramide synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2Q96G23 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CERS2Q96G23 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERS2Q96G23 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERS2Q96G23 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms