Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IMP4Q96G21 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms