Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDL1Q96EA4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPDL1Q96EA4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms