Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRRFQ96E11 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRRFQ96E11 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRRFQ96E11 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms