Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB39BQ96DA2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB39BQ96DA2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms