Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C12orf43Q96C57 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C12orf43Q96C57 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C12orf43Q96C57 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C12orf43Q96C57 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C12orf43Q96C57 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C12orf43Q96C57 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms