Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SYTL4Q96C24 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYTL4Q96C24 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms