Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX58Q96C10 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX58Q96C10 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DHX58Q96C10 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX58Q96C10 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX58Q96C10 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX58Q96C10 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX58Q96C10 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX58Q96C10 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX58Q96C10 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX58Q96C10 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX58Q96C10 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX58Q96C10 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX58Q96C10 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX58Q96C10 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX58Q96C10 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX58Q96C10 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX58Q96C10 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms