Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSC1Q92574 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSC1Q92574 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSC1Q92574 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms