Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3S1Q92572 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3S1Q92572 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms