Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtpbp3Q923K4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtpbp3Q923K4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp3Q923K4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms