Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nrif1Q923B3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nrif1Q923B3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrif1Q923B3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms