Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spdl1Q923A2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spdl1Q923A2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spdl1Q923A2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms