Protein–RNA interactions for Protein: Q92393

TY1B-OR, Transposon Ty1-OR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ORQ92393 ORC5YNL261W 1440 nt9.14□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 XBP1YIL101C 1944 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 TRR1YDR353W 960 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 LEU5YHR002W 1074 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 KTR1YOR099W 1182 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 GIT1YCR098C 1557 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 GUD1YDL238C 1470 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 CHA1YCL064C 1083 nt9.12□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt9.12□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt9.12□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 YGL235WYGL235W 537 nt9.12□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 MDL2YPL270W 2322 nt9.11□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 YKR032WYKR032W 315 nt9.11□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 BSC4YNL269W 396 nt9.11□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 BBP1YPL255W 1158 nt9.1□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 SLA2YNL243W 2907 nt9.1□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 YDR109CYDR109C 2148 nt9.1□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 PRO3YER023W 861 nt9.09□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 MCH2YKL221W 1422 nt9.09□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 COX16YJL003W 357 nt9.09□□□□□ -0.95
TY1B-ORQ92393 RTG2YGL252C 1767 nt9.08□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 PRM10YJL108C 1152 nt9.08□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 THI2YBR240C 1353 nt9.08□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 GAT3YLR013W 426 nt9.07□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 ATP14YLR295C 375 nt9.07□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 YGR176WYGR176W 348 nt9.07□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 DPH5YLR172C 903 nt9.07□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 RPL5YPL131W 894 nt9.07□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 TAH11YJR046W 1815 nt9.06□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 ALR1YOL130W 2580 nt9.06□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 MET2YNL277W 1461 nt9.05□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 SHM1YBR263W 1473 nt9.05□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 GTT3YEL017W 1014 nt9.05□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt9.05□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 QNS1YHR074W 2145 nt9.05□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 YDL034WYDL034W 345 nt9.04□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 QCR8YJL166W 285 nt9.04□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 GSH1YJL101C 2037 nt9.04□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 UFD1YGR048W 1086 nt9.04□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 PGU1YJR153W 1086 nt9.04□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 COX9YDL067C 180 nt9.03□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 CWC21YDR482C 408 nt9.03□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 SLO1YER180C-A 258 nt9.03□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 HSX1tR(CCU)J 72 nt9.03□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 YAP1801YHR161C 1914 nt9.03□□□□□ -0.96
TY1B-ORQ92393 IPI1YHR085W 1005 nt9.02□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 DJP1YIR004W 1299 nt9.02□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 ECM15YBL001C 315 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 DAL82YNL314W 768 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 GPH1YPR160W 2709 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 NOB1YOR056C 1380 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 YKL151CYKL151C 1014 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 AIM34YMR003W 597 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 NDC1YML031W 1968 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 TIM54YJL054W 1437 nt9□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 ATO3YDR384C 828 nt9□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 YHC3YJL059W 1227 nt9□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 CYB2YML054C 1776 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 GIR2YDR152W 798 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 YDR154CYDR154C 351 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 HCR1YLR192C 798 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 YMC1YPR058W 924 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 YBR144CYBR144C 315 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 YHM2YMR241W 945 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 CSG2YBR036C 1233 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 UTR4YEL038W 684 nt8.98□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 RTT106YNL206C 1368 nt8.98□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 CAD1YDR423C 1230 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 CIS3YJL158C 684 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 KKQ8YKL168C 2175 nt8.96□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 RPT6YGL048C 1218 nt8.96□□□□□ -0.97
TY1B-ORQ92393 YCL065WYCL065W 369 nt8.96□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 SAM4YPL273W 978 nt8.96□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 PMT3YOR321W 2262 nt8.96□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 YJR115WYJR115W 510 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 OPI8YKR035C 642 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 YBR124WYBR124W 360 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 AGP2YBR132C 1791 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 APS3YJL024C 585 nt8.94□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 VPS61YDR136C 573 nt8.94□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 PGM1YKL127W 1713 nt8.94□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 COT1YOR316C 1320 nt8.93□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 PAC10YGR078C 600 nt8.93□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 YLL059CYLL059C 507 nt8.92□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 BNA3YJL060W 1335 nt8.92□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 YNL296WYNL296W 315 nt8.91□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 YOR318CYOR318C 306 nt8.9□□□□□ -0.98
TY1B-ORQ92393 YMR010WYMR010W 1218 nt8.89□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 YHR127WYHR127W 732 nt8.89□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 VRP1YLR337C 2454 nt8.87□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.2 ms