Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Afg3l1Q920A7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afg3l1Q920A7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms