Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek8Q91ZR4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nek8Q91ZR4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek8Q91ZR4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms