Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usb1Q91W78 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usb1Q91W78 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usb1Q91W78 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usb1Q91W78 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usb1Q91W78 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms