Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY21

SORCS1, VPS10 domain-containing receptor SorCS1, humanhuman

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1Q8WY21 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORCS1Q8WY21 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORCS1Q8WY21 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SORCS1Q8WY21 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SORCS1Q8WY21 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms