Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNKSR2Q8WXI2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNKSR2Q8WXI2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNKSR2Q8WXI2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNKSR2Q8WXI2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CNKSR2Q8WXI2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNKSR2Q8WXI2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNKSR2Q8WXI2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CNKSR2Q8WXI2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNKSR2Q8WXI2 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNKSR2Q8WXI2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNKSR2Q8WXI2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNKSR2Q8WXI2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNKSR2Q8WXI2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms