Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV35

LRRC29, Leucine-rich repeat-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC29Q8WV35 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC29Q8WV35 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC29Q8WV35 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms