Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmcd1Q8VEE1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmcd1Q8VEE1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmcd1Q8VEE1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms