Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smg8Q8VE18 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg8Q8VE18 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg8Q8VE18 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms