Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep57l1Q8VDS7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep57l1Q8VDS7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep57l1Q8VDS7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep57l1Q8VDS7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep57l1Q8VDS7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep57l1Q8VDS7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep57l1Q8VDS7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep57l1Q8VDS7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep57l1Q8VDS7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep57l1Q8VDS7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cep57l1Q8VDS7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep57l1Q8VDS7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms