Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC33

Nxnl1, Nucleoredoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxnl1Q8VC33 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxnl1Q8VC33 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nxnl1Q8VC33 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nxnl1Q8VC33 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxnl1Q8VC33 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxnl1Q8VC33 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxnl1Q8VC33 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxnl1Q8VC33 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxnl1Q8VC33 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxnl1Q8VC33 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxnl1Q8VC33 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxnl1Q8VC33 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxnl1Q8VC33 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxnl1Q8VC33 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxnl1Q8VC33 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxnl1Q8VC33 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms