Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PATJQ8NI35 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATJQ8NI35 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms